ועדת סוארי מסרה את המלצותיה לענין בחינת מבנה רשות המסים. בקליפת האגוז, הוועדה ממליצה למנות את מנהל רשות המסים לנציב מס הכנסה ומיסוי מקרקעין ולמנות את מנהל המכס ומע"מ, כמשנה וכממלא מקומו מנהל רשות המסים. לצדו של מנהל רשות המסים יפעל מטה מס הכנסה ומיסוי מקרקעין, המורכב מסמנכ"לים ובעלי תפקידים משותפים לשני האגפים- שירות לקוחות, תכנון ואסטרטגיה, מבקר פנים וחשב; ומסמנכ"לי מס הכנסה ומיסוי מקרקעין- שומה, מקצועית, משפטית, משאבי אנוש, גבייה, מודיעין וחקירות, ומקרקעין. במקביל, לצדו של מנהל המכס ומע"מ יפעל מטה, המורכב מסמנכ"לי מכס ומע"מ- שומה, מקצועית, משפטית, משאבי אנוש, גבייה, מודיעין וחקירות, מכס, וישתתפו בו גם הסמנכ"לים ובעלי התפקידים המשותפים לשני האגפים. לדברי הועדה, חלופה זו נבחרה, לאחר בחינה מדוקדקת של חלופות נוספות והיא נמצאה כחלופה הישימה ביותר ובעלת הפוטנציאל המידי והעתידי הרב ביותר, ליצירת שיתופי פעולה בין האגפים ויצירת תהליכים, שיובילו למהלך של איחוד מלא בטווח הארוך.